El hospital está dividido en varios departamentos.

Medicina interna y cirugía son las ramas de primer nivel del hospital, medicina cardiovascular y gastroenterología son las ramas de segundo nivel y nefrología y diabetes son las ramas de tercer nivel. Los hospitales pequeños tienen un solo nivel de sucursales, mientras que los hospitales grandes y medianos tienen dos o tres niveles de sucursales.

La medicina interna es un departamento donde el tratamiento farmacológico es el método principal. Las principales ramas son: medicina cardiovascular, gastroenterología, medicina respiratoria, urología (nefrología), neurología, hematología y endocrinología;

La cirugía es un departamento profesional que utiliza la resección y reparación quirúrgica como principal método de tratamiento. En los últimos años, con la aplicación de la tecnología de microcirugía, los procedimientos quirúrgicos han logrado grandes avances. Los principios para la creación de especialidades en el Departamento de Cirugía de cada hospital son similares a los del Departamento de Medicina Interna, y suelen corresponder al Departamento de Medicina Interna. Las principales ramas son: cirugía general (denominada cirugía general), cirugía cardiotorácica, urología, ortopedia, neurocirugía y quemados y cirugía plástica.

Se recomienda consultar el sitio web del Peking Union Medical College Hospital. Las sucursales allí están muy detalladas.