¿Qué significa abundancia de mutaciones?
Tome como ejemplo la mutación de EGFR más común en el cáncer de pulmón. "Abundancia" puede entenderse simplemente como la concentración de la frecuencia de mutación de EGFR en el ADN total. Algunos estudiosos definen la abundancia como la proporción entre mutaciones de EGFR y copias de tipo salvaje, pero actualmente no existe una definición clara.
La abundancia de mutaciones detectadas mediante pruebas genéticas en diferentes pacientes variará mucho, principalmente en relación con la heterogeneidad del tumor. En el pasado, pensábamos que las células tumorales de un mismo individuo eran idénticas, con los mismos genes y la misma estructura espacial. Sin embargo, a medida que la tecnología de detección se vuelve cada vez más precisa, hemos descubierto que los genes, las proteínas y otras estructuras de las células tumorales en la misma muestra de tejido no son consistentes.
Esta característica es relativamente popular y puede expresarse como un viejo dicho: "Una madre da a luz a nueve hijos, y los nueve hijos son diferentes". Las células tumorales colonizadoras iniciales han evolucionado hacia diferentes descendientes.
Los tumores en la misma ubicación producirán diferentes expresiones genéticas, y la expresión de los tumores en diferentes ubicaciones puede cambiar, y habrá diferencias entre diferentes personas. Desde una perspectiva macro, los tumores son diferentes a las personas, y desde una perspectiva micro, los tumores también son diferentes.
Como resultado, incluso si diferentes pacientes tienen la misma mutación genética, la abundancia de la mutación será diferente y, por tanto, la respuesta al mismo fármaco será diferente.
En sus inicios, la definición de abundancia estaba relacionada con la sensibilidad del método de detección genética. Por ejemplo, el método de secuenciación directa requiere que la frecuencia de mutación del EGFR alcance el 20%-30%, mientras que la detección ARMS solo requiere que la frecuencia de mutación del EGFR alcance el 65438±0%. Siempre que se detecta una mutación, ésta es muy abundante. Sin embargo, esta definición es demasiado general para distinguirla.
Sin embargo, actualmente no existe un estándar de intervalo unificado para juzgar la abundancia y el bajo valor de las pruebas genéticas. Diferentes métodos de clasificación y diferentes empresas de pruebas tendrán diferentes configuraciones numéricas.