¿Para qué sirve la secuenciación del genoma vegetal?

Con la ayuda de métodos bioinformáticos, se analizan las diferencias estructurales entre diferentes genomas individuales y al mismo tiempo se completan las anotaciones de la estructura del genoma y los SNP. Las mutaciones del ADN pueden causar cáncer.

Se liberan al fumar> 60 sustancias químicas cancerígenas pueden unirse al ADN y modificar químicamente la guanina y la adenina en la cadena del ADN, produciendo grandes aductos y cambiando la estructura de la doble hélice del ADN.

Si no se corrige mediante reparación por escisión de nucleótidos u otros medios, el ADN se replicará de una manera distinta a la de Watson-Crick e impedirá que la ARN polimerasa se transcriba, lo que provocará cáncer.

Datos ampliados:

Índice de clasificación

Profundidad

La profundidad de secuenciación es el número total de bases (pb) obtenidas mediante la secuenciación y el Tamaño del genoma La relación es uno de los indicadores para evaluar el volumen de secuenciación. La profundidad de la secuenciación se correlaciona positivamente con la cobertura del genoma, y ​​la tasa de error o los resultados falsos positivos causados ​​por la secuenciación disminuirán a medida que aumente la profundidad de la secuenciación.

Cuando la profundidad de secuenciación es superior a 50X~100X, se puede controlar la cobertura del genoma y la tasa de error de secuenciación, y las secuencias posteriores se pueden ensamblar en cromosomas con mayor facilidad y precisión.

Reportajes de noticias

Cobertura de secuenciación: la proporción del genoma cubierto por bases obtenidas mediante la cobertura de secuenciación es uno de los indicadores que refleja la aleatoriedad de la secuenciación; y cobertura Se puede determinar utilizando el modelo de Lander-Waterman (1988). Cuando la profundidad alcanza 5X, puede cubrir más del 99,4% del genoma.