Aplicación de cgh en la investigación de patología tumoral
(1) Ganancia y pérdida de ADN en regiones cromosómicas tumorales
Los estudios han demostrado que en muchos tumores malignos, como el cáncer de mama, el cáncer de ovario, el cáncer de próstata y el cáncer de pulmón, las regiones cromosómicas 1q, 3q y 8q suelen tener ganancias, mientras que 8p, 13q, 16q y 17p suelen tener pérdidas. Las ganancias de 12p y Xp ocurren en el cáncer testicular, la pérdida de 14q ocurre en el cáncer renal y la pérdida de Xp ocurre en el cáncer de ovario. La eliminación de estos sitios específicos refleja la singularidad del proceso de carcinogénesis. Para evaluar la ganancia y pérdida de material genético en tumores sólidos malignos, Mertens et al [6] seleccionaron 11 tipos de tumores reportados en la literatura. Según 508 casos de cáncer de mama, 447 casos de tumores neurológicos malignos, 435 casos de cáncer de riñón, 333 casos de cáncer de colon, 304 casos de cáncer de ovario, 303 casos de cáncer de pulmón, 209 casos de tumores de células germinales testiculares, 206 casos de cáncer de cabeza y cuello, 172 casos de melanoma maligno, 142 información citogenética de 126 casos de nefroblastoma y 126 casos de neuroblastoma encontraron que todos los tumores tienen su propia distribución desequilibrada de ganancias y pérdidas. Sin embargo, también existe una superposición considerable entre los diferentes tipos de tumores. tumores, lo que sugiere que muchos tumores tienen mecanismos moleculares similares, el grado de pérdida de todos los tumores es significativamente mayor que la ganancia. Los cromosomas de la mayoría de los tumores son X, Y, 4, 10, 13 ~ 15, 18 y 22, y los segmentos cromosómicos son 1p22-pter, 3p13-pter y 6q14-qter. En el cáncer de pulmón de células pequeñas, la mejora de la señal es común en los cromosomas 3q (85%), 5p (70%), 7p (70%), 7q (65%) y 8q (65%), y también se observa en los cromosomas 1q. , 2p y 20p. 3q26, 8q24, 3q28-qter, 7q11.2, 8p11-12, 12P15438+. Los cromosomas con atenuación de señal más frecuente son 3p21, 8p21-pter, 15q 11.2-13 y 5q11.2-15.
(2) Identificación de genes diana para la ganancia y pérdida de ADN
CGH puede localizar con precisión genes tumorales, especialmente los sitios cromosómicos donde se produce la ganancia de ADN. Los estudios han demostrado que algunos tumores tienen múltiples ganancias de subregiones cromosómicas o amplificaciones del número de copias de ADN. Se ha descubierto que hasta 30 subregiones cromosómicas del cáncer de mama están involucradas en ganancias y pérdidas, lo que es significativamente mayor que los resultados del mapeo con sondas de ADN específicas de oncogenes. Morchio et al. realizaron CGH en 50 pacientes con carcinoma hepatocelular (CHC) avanzado e infección por VHB y encontraron que los brazos cromosómicos 4q (70%) y 8p (65%) se perdían con mayor frecuencia, ubicados en la pequeña área superpuesta de 4q21. y 8p21-23. Estudios anteriores encontraron 4T21-23 en CHC altamente diferenciado. El estudio RFLP mostró la presencia del gen PRLTS (gen supresor de tumores similar al receptor beta de PDGF) en 8p21.3-22. También se confirmó la pérdida de los brazos cromosómicos 16q (54%), 17p (51%), 13q (37%), 6q (37%) y 1p36 (30%), lo que representa el 23%. Hay dos regiones eliminadas en el cromosoma 13q, que contienen los genes supresores de tumores RB1 (13q14) y BRCA2 (13q12), respectivamente. Los brazos de cromosomas 8q (60%), 1q (58%), 6p (33%) y 17q (33%) ganaron con frecuencia, y las regiones superpuestas más pequeñas se ubicaron en 1q11-25 y 8q22-24. También se encontraron amplificaciones en 11q12, 12p11, 14q12 y 19q13.1. El aislamiento y la clonación de estas regiones eliminadas o ganadas conducirán al descubrimiento de nuevos oncogenes y genes supresores de tumores.
(3) Aplicaciones como estadificación y clasificación de tumores.
Los estudios CGH de 29 casos de carcinoma de células escamosas de cabeza y cuello metastásico (pN+) y 19 casos de carcinoma de células escamosas de cabeza y cuello no metastásico (pNO) mostraron que los tumores pNO tenían una sobreexpresión de los cromosomas 5p, 6p y 7p. Sin embargo, las deleciones de los cromosomas 7q, 10q, 11p, 11q, 15q y 20p y la sobreexpresión de los cromosomas 19q y 20q ocurren con frecuencia en los tumores pN+. Las tasas de pérdida de los cromosomas 10q25-q2611 y p13-p14 aumentan significativamente en el cáncer metastásico.
El análisis de heterocigosidad de los polimorfismos de microsatélites también confirmó anomalías en el cromosoma 10q, lo que sugiere que este cambio genético único está asociado con el fenotipo metastásico del carcinoma de células escamosas de cabeza y cuello. Weber et al [10] utilizaron CGH para escanear 19 casos de meningiomas benignos (grado ⅰ, M ⅰ de la OMS), 21 casos de meningiomas atípicos (grado ⅱ, M ⅱ de la OMS) y 19 casos de meningiomas anaplásicos. Se encontró que a medida que aumenta el grado de malignidad, aumenta el desequilibrio cromosómico. Los cambios en el número total de tumores por tumor fueron 2,9 ± 0,7, 9,2 ± 1,2 y 13,3 ± 1,9 respectivamente, y el cambio más común en Mⅰ fue la pérdida de 22q. 1p (76%), 22q (71%), 14q (43%), 18q (43%), 10q (33%) y 6q (33%) en tejidos tumorales M ⅱ. En los tejidos tumorales Mⅲ, además de frecuencias similares a Mⅱ, aumentó la frecuencia de pérdida de 6q (53%), 10q (68%) y 14q (63%), la tasa de pérdida de 9p fue del 32% y 4/16 (25%) Mⅲ tejido tumoral apareció en 9p. Hubo 1 caso de tejido tumoral M ⅱ y 8 casos de tejido tumoral M ⅲ con amplificación de la secuencia de ADN 17q23. Aunque hubo una alta frecuencia de anomalías cromosómicas en todos los tejidos tumorales de grado II y III, no hubo mutación en los exones 5-8 de TP 53 en 1 caso. Se especula que las anomalías en el genoma del tumor pueden estar relacionadas con la progresión de los meningiomas.